PrimerCat面向科研

引物一键获取靠谱引物

转录本Primer3BLAST评分全程自动 · 每步可查
自动选取最佳转录本
逐条引物 BLAST 验证
5 轴评分,每项得分可见
12,400+
已设计引物对数
600+
注册用户数
人类小鼠
支持物种

从基因名到候选引物

三个自动化步骤——无需手动查库,无需在多个工具间复制粘贴。

01

输入基因名或序列

输入 HGNC 基因符号(如 TP53)或直接粘贴 DNA 序列,选择物种,提交。

基因名称
TP53
人类
小鼠
开始设计 →
NM_000546
NM_001126112
02

流程自动运行

系统查询 RefSeq 主要转录本,Primer3 完成跨外显子设计,两条引物分别 BLAST 比对 RefSeq RNA,全程无需干预。

RefSeq 转录本
Primer3 设计
BLAST 验证
打分排序
03

查看完整评分明细

每对引物按 Tm、GC%、BLAST 特异性、跨外显子、二聚体风险五个维度打分。各维度得分一一展示,推荐依据一目了然。

#1
引物对 1推荐
Tm 61.2°C · GC 52%跨外显子
94
/100
#2
引物对 2
Tm 59.8°C · GC 48%跨外显子
88
/100
#3
引物对 3
Tm 60.4°C · GC 55%
81
/100

流程实际做了什么

每个决策都展示,每个数字都有来源。

🧬

转录本筛选

从 NCBI RefSeq 获取 NM_ 编码转录本,优先选取 CDS 完整、外显子最多的主要转录本,并说明选择理由。

🔬

跨外显子设计

引物跨越内含子连接位点——基因组 DNA 污染会产生更长的扩增产物或无产物,而非假阳性。

🎯

逐条引物 BLAST 验证

每条引物单独比对 RefSeq RNA,展示 Top 3 命中基因,脱靶数计入最终评分。

📊

5 轴加权评分

Tm、GC%、BLAST 特异性、跨外显子、二聚体风险——每个轴的得分在每张结果卡上逐一显示。

🔭

完整 Primer3 原始输出

自互补 Tm、3′端 Tm、发卡 Tm、GC clamp——原始数值,不是摘要。

📄

导出实验记录

CSV 数据表用于分析 + HTML 完整报告附方法说明,适合论文补充材料。