PrimerCat面向科研
引物猫 — 一键获取靠谱引物
转录本→Primer3→BLAST→评分全程自动 · 每步可查
自动选取最佳转录本
逐条引物 BLAST 验证
5 轴评分,每项得分可见
12,400+
已设计引物对数
600+
注册用户数
人类小鼠
支持物种
使用流程
从基因名到候选引物
三个自动化步骤——无需手动查库,无需在多个工具间复制粘贴。
01
输入基因名或序列
输入 HGNC 基因符号(如 TP53)或直接粘贴 DNA 序列,选择物种,提交。
基因名称
TP53
人类
小鼠
开始设计 →
NM_000546
NM_001126112
02
流程自动运行
系统查询 RefSeq 主要转录本,Primer3 完成跨外显子设计,两条引物分别 BLAST 比对 RefSeq RNA,全程无需干预。
RefSeq 转录本✓
Primer3 设计✓
BLAST 验证✓
打分排序
03
查看完整评分明细
每对引物按 Tm、GC%、BLAST 特异性、跨外显子、二聚体风险五个维度打分。各维度得分一一展示,推荐依据一目了然。
#1
引物对 1推荐
Tm 61.2°C · GC 52%跨外显子
94
/100
#2
引物对 2
Tm 59.8°C · GC 48%跨外显子
88
/100
#3
引物对 3
Tm 60.4°C · GC 55%
81
/100
工具套件
三款工具,贯穿核心流程
从引物设计到 CRISPR gRNA 到序列比对,覆盖分子生物学实验核心步骤。
流程实际做了什么
流程实际做了什么
每个决策都展示,每个数字都有来源。
转录本筛选
从 NCBI RefSeq 获取 NM_ 编码转录本,优先选取 CDS 完整、外显子最多的主要转录本,并说明选择理由。
跨外显子设计
引物跨越内含子连接位点——基因组 DNA 污染会产生更长的扩增产物或无产物,而非假阳性。
逐条引物 BLAST 验证
每条引物单独比对 RefSeq RNA,展示 Top 3 命中基因,脱靶数计入最终评分。
5 轴加权评分
Tm、GC%、BLAST 特异性、跨外显子、二聚体风险——每个轴的得分在每张结果卡上逐一显示。
完整 Primer3 原始输出
自互补 Tm、3′端 Tm、发卡 Tm、GC clamp——原始数值,不是摘要。
导出实验记录
CSV 数据表用于分析 + HTML 完整报告附方法说明,适合论文补充材料。